تدور أحداث رواية 2222 حول حدث بيئي/فيروسي خطير يتنبأ به الكنعانيون قبل آلاف الأعوام وينقلونه إلى الأجيال بوساطة نقوش على كهف في مدينة القدس. ينتقل عالم كيمياء جيولوجيَّة من العام 2222 (الزمن المتوقع للكارثة الذي يؤكده علماء المستقبل) عبر الزمان والمكان إلى مدينة القدس في العام 2019؛ ليستجلي حقيقة هذه النقوش، التي تكون قد اختفت تقريبًا في زمانه بفعل عوامل طبيعية. في بحثه يلتقي فتى وفتاة من مدينة القدس/2019 مهتمَّين بهذه النقوش.
وتدور أحداث القصة حول بحثهم جميعًا عن حل ينقذ البشرية في 2222. تمر القصة بمنعطفات مشوقة تعكس الفارق بين الزمنين في التكنولوجيا، وتحديدًا في مستوى التطور الذي تتوقعه الرواية لعلماء الأمة العربية. كما يمر أبطال القصة بصعوبات علمية وإجرائية من أجل الوصول إلى فك شيفرة النقوش وتحضير العلاج الوقائي للكارثة عبر عمليات كيميائية طويلة، وسط استهتار كثير من الباحثين في الوسط العلمي العالمي في عام 2222 واعتقادهم بأن ما يقوم به أبطال الرواية ضربٌ من الخرافة والجنون؛ إذ يبحثون في نقوش تنبؤية عمرها ثلاثة آلاف عام عن حل لمشكلة شديدة التعقيد البيوكيميائي في زمن متطور جدًّا من أزمنة البشرية.